Меры по общественному здоровью и репродуктивное число SARS-CoV-2

Меры по общественному здоровью и репродуктивное число SARS-CoV-2

В JAMA (Журнале Американской Медицинской Ассоциации) 1 мая 2020 г. была опубликована одноименная статья Томаса В. Инглесби из Школы Общественного здоровья университета Джона Хопкинса (Thomas V. Inglesby, MD, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, tinglesby@jhu.edu). В США меры общественного здоровья включают вопросы санитарно-эпидемиологической безопасности (в РФ аналог службы – Роспотребнадзор). Перевод сделан д.м.н. Г.Э. Улумбековой. Оригинал статьи доступен по ссылке https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2765665.

Коронавирусная болезнь (COVID-19) – острое респираторное инфекционное заболевание с тяжелым респираторным дистресс синдромом, которое вызывается коронавирусом — SARS-CoV-2. Это заболевание было впервые зарегистрировано в начале декабря 2019 г. в Ухани (Китай) и с тех пор распространилось по всему миру.

Одна из характеристик распространения вируса – это R0 или ожидаемое число случаев заражения, произведенных первичным зараженным за определенное время. Оно используется для оценки распространения эпидемии среди подверженного данной инфекции популяции (без применения противоэпидемическим мер). Эффективное репродуктивное число Rt показывает время распространения эпидемии за определенное время t при наличии контрольных мер, рис. 1.

Для оценки эффективности контрольных  мер  по  распространению  инфекции  Rt должно определяться в различных местах, в идеале — регулярно, через определенные интервалы, например, раз в неделю.

 В предыдущей статье в JAMA, Pan и коллеги1 оценили воздействие мер по контролю эпидемии COVID-19 в Ухани в течение 5 основных периодов, в зависимости от принимаемых мер — санитарные кордоны (cordons sanitaire), ограничение передвижений транспорта, социальное дистанцирование, жесткая домашняя изоляция, централизованное нахождение заразившихся в карантине, всеобщий контроль за симптомами. Ученые установили, что Rt — это индикатор для оценки передачи SARS- CoV-2 до и после вмешательств.

В своей статье они показали экстраординарное снижение частоты распространения SARS-CoV-2, связанное с принятыми мерами – см. рис.2. Вначале эпидемии (в середине января) SARS-CoV-2 эпидемия в Ухани имела Rt от 3 to 4. Другими словами, каждый зараженный передавал инфекцию еще 3-4 другим людям. Это очень большое число, для сравнения при обычном гриппе, который ежегодно возникает в мире, Rt составляет от 1,4 до 1,7. С учетом того, что время удвоения SARS-CoV-2 составляет 5 дней (другими словами через пять дней будет заражено 4², еще через пять дней — 4²х4, и т.д., через 30 дней число заражений составит 4⁶), было очевидно, что эта эпидемия выйдет из-под контроля.

Рис 1. Концепция эффективного репродуктивного числа


Рис 2. Эффективное репродуктивное число (R
t) по данным лабораторно- подтвержденных случаев (COVID-19) в Ухане, Китай 

Китайским правительством 23 января были приняты меры по закрытию города и централизации карантина. Некоторые меры, принятые в Ухане, считались бы в других странах социально неприемлемыми и невыполнимыми, например, полный контроль за передвижением и принудительное нахождение на карантине в специально отведенных для этого местах.

Другие меры, принятые в Ухане (но не показанные на рисунке), включали: закрытие бизнесов, школ, отмену всех общественных мероприятий. Они также сыграли свою роль в снижении социальных контактов. Эти последние меры – легли в основу тех, которые приняли Правительства других стран для снижения распространения SARS-CoV-2.

Но все вместе принятые в Ухане меры, позволили снизить Rt эпидемии ниже единицы за несколько недель. Если Rt для определенной болезни и в определенном месте снижается ниже 1, то эпидемия может быть взята под контроль.

 На рисунке 2 показано, какая цель должна быть сегодня поставлена в мире. Пока не будет разработана и распространена по всему миру эффективная вакцина, страны, путем сочетания мер социальной изоляции, должны добиться снижения их репродуктивного числа Rt ниже 1.

Возможно, удастся добиться таких стратегий социальной изоляции, чтобы позволить экономике заработать, а обществу вернуться к некоторому подобию нормальной жизни. Учитывая тяжелые экономические и социальные последствия таких стратегий, необходимо постоянно контролировать эффективность мер социальной изоляции при их максимальном применении и при их последующем облегчении. Кроме закрытия школ, отмены мероприятий, должны обязательно соблюдаться – физическая дистанция (2 м), обязательное ношение масок в общественных местах, дистанционная работа. Все это может помочь снизить число Rt.

Если же меры социальной изоляции соблюдаться не будут вообще, то SARS-CoV-2 может вернуть свою скорость распространения, как в начале января, с Rt от 2-х до 4-х и периодом удвоения — 5 дней. Это будет продолжаться до тех пор, пока значительная часть населения не приобретет иммунитет после болезни или вакцинации.

Американский центр по контролю и предотвращению заболеваний (Centers for Disease Control and Prevention — CDC) должен регулярно докладывать Rt в США для каждого штата. На основании этого руководители службы общественного здоровья (в РФ — аналог Роспотребнадзор) должны оценивать эффективность коллективных и индивидуальных мер по снижению распространения вируса. Затем, СDC должен открыто объяснять это населению, чтобы оно было вовлечено и понимало смысл принимаемых мер по снижению распространения COVID-19.

Отправьте запрос.
Мы в максимально короткие сроки ответим.

    Нажимая кнопку «Отправить», вы подтверждаете своё согласие на обработку персональных данных в соответствии с ФЗ-152 «О персональных данных».


    спс
    Технические решения
    Настройка справочников

    Справочники системы – структурированные данные, объекты базы данных, служащей для хранения справочной информации. Настройка справочника осуществляется с учетом федеральных требований под потребности и особенности технологических процессов определенной станции переливания крови, что позволяет четко определять данные, необходимые для работы с системой.

    Безопасное хранение данных

    Индивидуальная настройка параметров доступа к системе в соответствии с должностными обязанностями сотрудников. Обеспечение безопасности данных согласно ФЗ №152 от 27.07.2006 г. Протоколирование действий пользователей. Изоляция серверов БД. Архивация и защита данных.

    Взаимодействие

    Интеграция с внешними системами. Создание единого информационного пространства (городской ЕДЦ, региональный ЕДЦ). Интеграция с базами данных, реестрами и регистрами (реестр отводов, Федеральный регистр доноров и др.), с ЛИС Innovasystem и другими гематологическими системами, Федеральным информационным центром и ПАК НИЦ МБУ.

    Статистика и аналитика

    Неограниченные возможности обработки и представления статистических и аналитических данных, визуализация и печать в табличной и графической форме. Выгрузка данных во внешние программы для дальнейшей обработки и печати: табличные редакторы, BI-системы и др.

    Единый донорский центр
    Регистратура

    На этапе регистрации донора происходит большая часть ошибок в связи с вводом информации вручную, поэтому разработчики Innovasystem сделали удобными и максимально автоматизированными первичную регистрацию и поиск донора, его идентификацию при повторном визите.

    Штрихкодирование

    Для безопасности заготовки и хранения компонентов крови система ведет строгий учет и индивидуальную маркировку доноров и компонентов крови. Донор получает персональный идентификационный браслет и с ним проходит по всем этапам донации. Система штрих-кодирования на каждом этапе обеспечивает автоматическую идентификацию, сквозную прослеживаемость технологических операций и пути компонентов, позволяет мгновенно определить статус и место хранения материала.

    Вызов доноров

    Вызов донора по заявке, отправленной в донорский отдел. Система позволяет медицинской организации построить гибкую автоматизированную систему подбора и вызова донора, разработать и поддерживать комфортный график вызова донора по смс, e-mail, телефону, устанавливать периодичность, дату и время вызова.

    Осмотр врача

    Управление электронной очередью доноров; вызов при помощи информационного табло; поиск карты визита донора по штрих -коду; регистрация и сохранение в историю донора любых критериев врачебного осмотра; автоматическое определение типа донации по группе донора; автоматическое отведение донора по результатам врачебного осмотра.

    Донация

    Функционал модуля позволяет организовать высокотехнологичный процесс заготовки и обработки донорской крови и ее компонентов, сформировать электронную очередь и календарь вызова донора, обеспечить подключение оборудования для заготовки крови и её компонентов. Гарантирован контроль над производством компонентов на каждом этапе, контроль безопасности донорской крови, получение лабораторных результатов из ЛИС.

    Интеграция

    Интеграция лабораторной информационной системой с системой НАИСТ обеспечивает высочайший уровень контроля и безопасности донации, процессов заготовки и производства компонентов крови на федеральном уровне.

    Заготовка и переработка компонентов
    Выездные пункты донаций

    Мобильное рабочее место выездной бригады позволяет провести проверку доноров по базе данных, зарегистрировать донора, проверить по реестру лиц, отведенных от донорства, зарегистрировать кроводачи в выездных условия, выбрать параметры предварительного лабораторного обследования, обеспечивая возможность работы с предварительно напечатанным штрих-кодом.
    После возвращения бригады система позволяет оперативно провести синхронизацию данных выездной бригады и данных (базы данных) СПК.

    Криобанк

    Банк длительного хранения компонентов крови позволяет лечебному учреждению выстроить индивидуальную стратегию заготовки и хранения компонентов крови с редкими фенотипами, отрицательными резус-факторами и т.д. Система позволяет организовать в лечебном учреждении банк костного мозга и банк стволовых клеток.

    Карантин

    Распределение компонентов, поступивших по приходным накладным. Создание, изменение, удаление, проведение «расходных накладных», управление банком карантинизации, отслеживание сроков годности хранящейся продукции, оперативный поиск компонентов на карантине по штрихкоду или по номеру и т.д.

    Экспедиция

    Организация процесса выдачи компонентов крови в лечебных учреждениях в удобном виде. Регистрация компонентов крови, отображение поступивших компонентов крови в табличном виде, подбор компонентов по критериям, регистрация брака для компонентов.

    Автоматическая выбраковка

    Компоненты крови проходят автоматическую проверку по результатам лабораторных исследований, система формирует и производит печать этикеток годной к выдаче продукции любых стандартов (ISBT-128), автоматическое проставление брака на компоненты, не разрешенные к выдаче.

    Переработка и производство

    Прием компонентов крови от отделения заготовки, отображение поступивших компонентов, отображение сводной информации о поступившей из отделения заготовке крови, ведение истории компонента крови, автоматическая регистрация брака и др.

    Интеграционные модули
    Неограниченные интеграционные возможности

    Система поддерживает информационное взаимодействие с любыми видами автоматического лабораторного оборудования (анализаторы, сортеры, роботизированные линии, станции пробоподготовки и т.д.) и обеспечивает безопасный обмен данными с любыми внешними информационными системами, регистрами и справочными системами.

    Интеграция с внешними системами

    Служба интеграции Innovasystem представляет унифицированный протокол связи ЛИС с внешними системами. В качестве транспортного уровня используется web-сервисы сообщений (WCF), обмен xml-файлами. Служба интеграции реализует двухсторонний обмен данными о пациенте и передачу графической информации.

    Интеграция с МИС МО

    ЛИС интегрирована со всеми основными РМИС региональных сегментов ЕГИСЗ Российской Федерации, с более чем 30 МИС и ЭМК медицинских организаций, список интеграций постоянно растет.

    Взаимодействие с анализаторами

    Основная задача подключения анализаторов к ЛИС – автоматизация отправки задания в анализатор и получения результатов, организация потоков проб, калибровка и контроль качества исследований. ЛИС обеспечивает интеграцию с анализаторами любого производителя. Обмен данными, включая графическую информацию, изображения и др., обеспечен в соответствии с протоколами управляющего ПО анализаторов.

    Интеграция с федеральными информационными системами и регистрами

    Реализована интеграция с рядом систем региональных сегментов ЕГИСЗ, автоматизированными информационными системами трансфузиологии «АИСТ» и «НАИСТ», программно-аппаратным комплексом Национального интеграционного центра мониторинга биологических угроз (ПАК НИЦ МБУ), Федеральным регистром пациентов с ВИЧ и др.

    Инструменты управления
    Управление производством исследований

    Контроль и управление процессами и производительностью в режиме онлайн. Оперативная информация о процессах, анализ нагрузки на оборудование и персонал, идентификация узких мест, прогноз поступления заказов.

    Управление номенклатурой исследований

    Простота и удобство централизованного управления номенклатурой исследований и тестов для подразделения, лаборатории, региональной лабораторной службы.

    Управление запасами

    Поступление реагентов и материалов, контроль остатков с учетом срока годности реагентов, контроль закупок, мониторинг остатков по источникам финансирования, автоматическое списание, инвентарные ведомости.

    Финансовые модули и экономическая аналитика

    Полная финансовая отчетность, включая контроль за оплатой услуг, акты выполненных работ, учет нагрузки, контроль рентабельности. Контроль за установленными квотами в рамках оказания государственных услуг в рамках заключенных договоров.

    Контроль себестоимости

    ЛИС предоставляет возможность каждой лаборатории индивидуально настроить функционал автоматического списания реагентов, рассчитать себестоимость каждого исследования.

    Статистика, аналитика и отчетность

    Модуль отчетности позволяет в одно действие создать отчет на любом этапе работы лаборатории, вывести его в графическом формате и экспортировать для дальнейшего редактирования. Статистика, аналитика, производственная отчетность и др. Формы отчета настраиваются персонально под каждую лабораторию.

    Для лабораторий любого профиля
    Российские инновации для отечественного здравоохранения

    ЛИС «Innovasystem» - комплексный инновационный продукт, созданный с учетом специфики отечественного здравоохранения на основе методик ведущих специалистов клинической лабораторной диагностики России.

    Функционал для экспресс лаборатории

    ЛИС позволяет оперативно создать заявку без внесения данных, отправить биоматериал в анализатор и получить результаты, а заявку заполнить позже. При создании таких заявок ЛИС поддерживает работу всех отделений и взаимодействие с анализаторами.

    Специальный модуль микробиологии

    Определение типов микроорганизмов. Составление антибиотикограммы. Определение чувствительности к антибиотикам. Формирование статических и эпидемиологических отчетов.

    Функционал всех видов исследований с учетом специфики

    • для биохимических и коагулологических лабораторий;
    • для гематологических и общеклинических лабораторий;
    • для лабораторий ИФА и ПЦР;
    • для цитологических лабораторий;
    • для иммунологических и иммунохимических лабораторий;
    • для гормональных лабораторий и методов и др.

    Гибкая настройка справочников

    Настройка разделов справочника происходит исходя из потребностей лаборатории, что позволяет гибко описать данные для управления системы: сведения о сотрудниках и о правах их доступа к ЛИС, исследованиях, анализаторах, аналитах, контрольных материалах, проводимых работах, запасах и др. Продуманная архитектура ЛИС Innovasystem позволяет быстро получать любую нужную информацию.

    Региональное решение
    Облачное решение

    Архитектура ЛИС позволяет автоматизировать лабораторную службу с учетом состояния инфраструктуры и нужд региональной системы здравоохранения – на базе единого ЦОД, распределенное решение с интеграцией через региональную шину данных, на безе централизованной КДЛ и др.

    Масштабирование

    ЛИС поддерживает неограниченное развитие лабораторной службы: расширение номенклатуры и объема исследований, расширение охвата медицинских организаций, развитие парка приборов, интеграцию с различными МИС.

    Веб-интерфейс

    Веб-модули ЛИС обеспечивают беспрецедентно низкую стоимость масштабирования РЛИС, охвата удаленных процедурных кабинетов и рабочих мест врачей-клиницистов.

    Соответствие требованиям

    ЛИС включена в Реестр российских программ для ЭВМ и баз данных и имеет регистрационное удостоверение медицинского изделия вида «Прикладное программное обеспечение для информационной системы клинической лаборатории».

    Гарантия безопасности

    Наличие лицензий Росздравнадзора и ФСТЭК России и сертификация системы управления качеством гарантируют полное соответствие требованиям к региональным информационным системам в составе ЕГИСЗ.

    Эффективность инвестиций

    Практические результаты подтверждают оптимальную стоимость развития и эксплуатации региональной информационной системы лабораторной службы на основе ЛИС INNOVASYSTEM.

    Повышение качества и доступности медицинской помощи
    Соответствие национальным стандартам

    Система обеспечивает повышение эффективности и мобильности управления лабораториями всех типов в соответствии с нормативными требованиями Министерства здравоохранения Российской Федерации, с учетом специфики отечественной системы оказания медицинской помощи.

    Штрихкодирование

    Индивидуальная маркировка контейнеров позволяет контролировать каждый этап исследования. Поддерживается сквозное штрихкодирование по заявкам, назначенным в МИС.

    Повышение эффективности

    ЛИС позволяет сократить время проведения исследований, увеличить производительность лаборатории, обеспечивает мгновенную доставку результатов врачу, контроль издержек и снижение себестоимости, повышение доступности медицинской помощи.

    Управление качеством на каждом этапе

    ЛИС обеспечивает повышение качества, соблюдение стандартов и правил на протяжении всего процесса проведения исследований: на преаналитическом, аналитическом и постаналитическом этапах.

    Планирование издержек

    Система - продукт отечественной разработки, в архитектуре системы не используются программные платформы, какое-либо встроенное ПО или middleware сторонних производителей. Стоимость поддержки системы, дополнительных АРМ и драйверов приборов фиксирована.

    Внутренний контроль качества

    Функционал ЛИС обеспечивает полное соответствие процессов и процедур проведения исследований рекомендациям Росздравнадзора по внутреннему контролю качества, критериям аккредитации диагностических и референтных лабораторий.